Helstu verkefni eru umsjón með kirkjunni og ábyrgð á rekstri hennar og fjármálum skv. 4. gr. máldaga um Stafkirkjuna dags. 17. maí 2010.
Stjórnin er þannig skipuð:
Kári Bjarnason tilnefndur af mennta- og menningarmálaráðherra,
Sólveig Adolfsdóttir tilnefnd af Vestmannaeyjabæ,
Sr. Guðmundur Örn Jónsson tilnefndur af Biskupi Íslands.
Varamenn eru:
Lára Skæringsdóttir tilnefnd af mennta- og menningarmálaráðherra,
Ragnar Óskarsson tilnefndur af Vestmannaeyjabæ,
Sr. Viðar Stefánsson tilnefndur af Biskupi Íslands.